Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms