Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Brf1Q8CFK2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Brf1Q8CFK2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Brf1Q8CFK2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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