Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx8Q8CFD4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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