Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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