Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms