Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Nhlrc3Q8CCH2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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