Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apol7cQ8C6E1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apol7cQ8C6E1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms