Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Znf428Q8C1M2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Znf428Q8C1M2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Znf428Q8C1M2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Znf428Q8C1M2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Znf428Q8C1M2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Znf428Q8C1M2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Znf428Q8C1M2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Znf428Q8C1M2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Znf428Q8C1M2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Znf428Q8C1M2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf428Q8C1M2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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