Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nek11Q8C0Q4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nek11Q8C0Q4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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