Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms