Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Usp38Q8BW70 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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