Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfr1Q8BP27 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfr1Q8BP27 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfr1Q8BP27 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfr1Q8BP27 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfr1Q8BP27 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfr1Q8BP27 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfr1Q8BP27 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfr1Q8BP27 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sfr1Q8BP27 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sfr1Q8BP27 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfr1Q8BP27 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms