Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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