Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnpo1Q8BFY9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms