Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms