Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms