Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms