Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms