Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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Shq1Q7TMX5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shq1Q7TMX5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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