Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usmg5Q78IK2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms