Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssh1Q76I79 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms