Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms