Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Timd4Q6U7R4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Timd4Q6U7R4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Timd4Q6U7R4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Timd4Q6U7R4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Timd4Q6U7R4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Timd4Q6U7R4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Timd4Q6U7R4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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