Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb40Q6PCS8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms