Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrimpolQ6P1E7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms