Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms