Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt77Q6IFZ6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms