Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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