Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms