Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms