Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms