Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rbm38Q62176 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rbm38Q62176 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rbm38Q62176 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rbm38Q62176 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rbm38Q62176 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rbm38Q62176 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbm38Q62176 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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