Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim27Q62158 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Trim27Q62158 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Trim27Q62158 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms