Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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PcolceQ61398 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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PcolceQ61398 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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PcolceQ61398 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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PcolceQ61398 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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PcolceQ61398 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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PcolceQ61398 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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PcolceQ61398 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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PcolceQ61398 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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PcolceQ61398 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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PcolceQ61398 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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PcolceQ61398 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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PcolceQ61398 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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