Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Neurod1Q60867 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Neurod1Q60867 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms