Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf3Q60765 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms