Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms