Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LpoQ5SW46 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LpoQ5SW46 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms