Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms