Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Utp18Q5SSI6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms