Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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