Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms