Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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