Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ulk4Q3V129 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ulk4Q3V129 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ulk4Q3V129 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ulk4Q3V129 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ulk4Q3V129 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ulk4Q3V129 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ulk4Q3V129 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ulk4Q3V129 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ulk4Q3V129 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ulk4Q3V129 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ulk4Q3V129 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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