Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc185Q3V118 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms