Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fchsd2Q3USJ8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fchsd2Q3USJ8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fchsd2Q3USJ8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fchsd2Q3USJ8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fchsd2Q3USJ8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fchsd2Q3USJ8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms