Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms