Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms