Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Usp19Q3UJD6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp19Q3UJD6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp19Q3UJD6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms