Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Snx27Q3UHD6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Snx27Q3UHD6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Snx27Q3UHD6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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